网上申请食品经营许可证的操作流程如下：

1. 访问该地区的政务服务网站并进入食品药品监督管理局页面。在办事服务类中寻找食品经营许可证核发，填写申请信息并上传相关材料。根据页面提示填写企业基本信息和经营类目等信息。网上填写完毕后，该窗口会显示已经申报成功，此时需要打印材料并签字盖章。提交纸质材料后，选择相应的办理地点进行提交。提交成功后，等待市场监督管理部门审核。审核通过后，持有效的证件到审核的部门领取食品经营许可证。

2. 具体填写内容包括经营者名称、经营者类型、经营者身份证信息等经营者的基本信息，以及主体业态和经营项目等许可信息。上传的材料包括经营业主的食品生产经营安全法律责任承诺签字文件及相关纸质证明文件材料扫描图片，具体要求要以相关文件精神为主进行制作。所填内容及上传的材料一定要准确无误并保证合法有效性。食品经营许可证申请书需要如实填写企业名称、地址、负责人姓名等基本信息，并根据自身业务填写具体的食品经营项目和要求等内容。申请书的填写一定要规范，以免因填写错误而导致审核失败或造成不必要的麻烦。网上申请成功后一定要记住回复回执上标注的受理编号以备后续查询所需使用。所有提交的材料电子版要求要清晰真实准确确保正常提交上传证件的图片清晰有效且格式符合要求。

以上流程仅供参考，具体流程和所需材料可能因地区而异，建议访问当地政务服务网站查询详细信息或咨询相关部门的工作人员获取准确信息。