开发用于改进癌症建模的遗传分析工具

良好的饮食习惯和锻炼等生活方式可能是影响一个人整体健康的重要因素。但患癌症的风险主要取决于个人遗传学的突发奇想。

我们的身体不断复制我们的基因以产生新细胞。然而，这些副本偶尔会出现错误，遗传学家称这种现象为突变。在某些情况下，这些错误会改变蛋白质、融合基因并​​改变基因的复制量，最终影响一个人患癌症的风险。科学家们可以通过开发肿瘤活动的预测模型来更好地了解突变的影响。

亚利桑那州立大学 Ira A. Fulton 工程学院生物医学工程助理教授 Christopher Plaisier 正在开发一种名为OncoMerge 的软件工具，该工具使用遗传数据改进癌症建模技术。

OncoMerge 是一个检测异常基因融合以及影响蛋白质表达和基因复制次数的突变的平台。然后，该软件分析突变背后的网络以揭示联系并开发模型来预测突变引起的未来变化。

“我们能够使用相关性来查看基因表达模式，”Plaisier 说，他也是亚利桑那州立大学生物计算、安全和社会生物设计中心的副教员。“然后我们可以看到什么被激活或抑制，这让我们能够看到背后更深层次的功能。”

自博士后工作以来，Plaisier 一直在思考 OncoMerge 的想法，在此期间，他首先注意到需要一个可以处理突变背后网络的平台。这项工作将他作为人类遗传学家、计算生物学家和癌症生物学家的专业知识结合到一个项目中。

他最近的研究通过设计一个数据库来解决基因突变检测的挑战，该数据库使用遗传数据来分析网络中的关联活动。结果发表在今天的Cell Reports Methods杂志上。

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